Nicole N. Thadani, Sarah Gurev, Pascal Notin, Noor Youssef, Nathan J. Rollins, Daniel Ritter, Chris Sander, Yarin Gal & Debora S. Marks
Nature 2023, https://doi.org/10.1038/s41586-023-06617-0
Published: 11 October 2023
Η αποτελεσματική ετοιμότητα απέναντι σε μία πανδημία βασίζεται στην πρόβλεψη των ιικών μεταλλάξεων που είναι σε θέση να αποφύγουν τις ανοσολογικές αποκρίσεις του ξενιστή, ώστε να διευκολυνθεί ο σχεδιασμός εμβολίων και θεραπειών. Ωστόσο, οι τρέχουσες στρατηγικές για την πρόβλεψη της εξέλιξης του ιού δεν είναι διαθέσιμες νωρίς σε μια πανδημία - οι πειραματικές προσεγγίσεις απαιτούν να δοκιμαστούν έναντι πολυκλωνικών αντισωμάτων του ξενιστή και οι υπάρχουσες υπολογιστικές μέθοδοι βασίζονται σε μεγάλο βαθμό στα τρέχοντα στελέχη για να κάνουν αξιόπιστες προβλέψεις των παραλλαγών που προκαλούν ανησυχία. Για να αντιμετωπιστεί αυτό, αναπτύχθηκε το EVEscape, ένα γενικεύσιμο αρθρωτό πλαίσιο που συνδυάζει προβλέψεις από ένα μοντέλο βαθιάς μάθησης ιστορικών ακολουθιών με βιοφυσικές και δομικές πληροφορίες.